光片中心数据传输优化

Wyss中心的高级光表成像中心（ ALICe ）是欧洲领先的神经成像设施之一，为多个机构的150多名用户提供服务。借助Teledyne Photometrics的Prime BSI Express等先进的显微镜系统和相机，研究人员可以捕获生成TB级数据的非常详细的数据集。通过1 Gbit/s连接移动单个2 TB数据集需要四个多小时。有限的存储、不断上涨的云成本和零散的访问减缓了全球范围内的协作和延迟的实验。

Wyss中心（瑞士日内瓦）为150多名用户和研究所提供服务，专门从事大型组织3D扫描、全脑成像、3D转录组学、神经元回路的神经解剖学等。Wyss中心内的高级光表成像中心(ALICe)是欧洲领先的神经成像设施之一，拥有先进的显微镜系统和科学相机，如Teledyne Photometrics的Prime BSI Express ，研究人员可以捕获生成TB级数据的非常详细的数据集。通过1 Gbit/s连接移动单个2 TB数据集需要四个多小时。有限的存储、不断上涨的云成本和零散的访问减缓了全球范围内的协作和延迟的实验。

dotphoton （瑞士楚格）专注于先进的图像数据压缩解决方案，可保持原始图像质量，同时显着缩小文件大小，非常适合高内容成像应用，例如ALIC使用的应用。dotphoton的主要图像数据管理解决方案是Jetraw ，该软件位于显微镜和存储系统之间，可简化从采集到存储的整个工作流程。Jetraw可加快数据传输速度，并将存储要求平均降低七倍，同时以合规和安全的方式保持RAW图像质量。

通过将Jetraw集成到Wyss中心的成像基础设施中，来自Teledyne Photometrics的Prime BSI Express等高级采集系统和科学相机的所有数据平均缩小了87% ，传输速度提高了700% ，同时保持了最高的图像质量。2 TB数据集现在只需30分钟即可移动，无需更改工作流程即可实现无缝的全球协作，并加快研究进度。

Wyss的高吞吐量成像系统每年生成超过100 TB的数据。其中， Clearscope光片显微镜产生的数据集要求特别苛刻，单个实验通常超过2 TB。通过1 Gbit/s连接传输此类数据集可能需要四个多小时，而存储限制、云成本和分散访问会减缓协作和延迟实验。

Jetraw解决方案已在所有光片系统中实施，以支持大规模成像数据集的高效处理和共享。在ClearScope上，针对大型和复杂样本的高分辨率成像进行了优化，例如全器官和多区域采集清除的人体组织， Jetraw保留了Teledyne Photometrics的Prime BSI Express相机的无与伦比的质量，下游可视化和分析。

Wyss中心实现了8: 1的压缩比，将存储需求减少了87% ，并将数据集传输时间从4小时缩短到30分钟。研究人员现在可以将数据共享速度提高七倍，使全球团队能够更有效地协作，同时降低基础设施成本。

在Jetraw之前，跨团队和系统传输数据的速度缓慢、成本高昂且不可靠。如今，数据集在本地存储系统、NAS和云环境之间顺利传输，压缩文件可直接在分析工具中访问。改进的数据处理能力使Wyss中心能够扩大对其设施的访问，加强国际合作，并支持处于研究前沿的新的大型神经科学项目。

Prime BSI Express是一款功能强大、灵活的光片显微镜解决方案，是Wyss中心ClearScope成像系统的首选sCMOS相机。得益于小像素和大视场，它可以在大样本上实现亚细胞分辨率。此外，由于存在高动态范围16位模式和低噪声12位CMS模式，用户可以选择成像模式，从而在高动态范围内实现高灵敏度成像。

Prime BSI Express还具有可编程扫描模式，可以控制相机读出的方向和速度。这对于扫描光片技术非常理想，在这种技术中，横跨样品的光束扫描可以与相机读数同步。

总体而言， Prime BSI Express是经过验证的光片显微镜解决方案，与Jetraw相结合，可以获取大量数据并轻松传输以进行分析。